Il est né à Sainte-Foy-la Grande dans la vaste demeure du notaire Chaucherie. Par sa mère, il descend des Reclus et des Trigant, laquelle fut élevée par son oncle Chaucherie et sa tante Louise Trigant. Son père Pierre Faure était clerc de notaire à l’étude Chaucherie.
Jean-Louis Faure fréquente le collège protestant de Sainte-Foy qu’il quitte en 1879 pour le collège Louis le Grand à Paris. Son service militaire accompli à Tarbes, il s’oriente vers la médecine. En 1887 reçu à l’internat à Bicêtre, soutenu par son oncle Paul Reclus, il se dirige vers la chirurgie où ses talents sont remarquables. Il sera assistant de son oncle Paul à l’hôpital de la Pitié.
Rénovateur dans la chirurgie gynécologique, il publie de nombreux ouvrages scientifiques entre 1905 et 1933.
En 1918, il succède à Samuel Pozzi à la chaire de la clinique gynécologique de la faculté de médecine de Paris. Elu membre de l’Académie de médecine en 1924, il devient président de la Société de chirurgie en 1925.
Sainte-Foy-la-Grande donnera une grande réception en 1935 pour l’honorer et une rue de Sainte-Foy prendra son nom.
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